Untuk meningkatkan kualitas menuju sekolah Yapendik yang Bermutu dalam Iman, Ilmu dan Amal Kasih, saat ini Yapendik terus-menerus melakukan perbaikan mulai dari manajemen di pusat, cabang, dan sekolah. Melalui beberapa Program antara lain:

Usaha Mempunyai 70 Sekolah

Sesuai sasaran jangka pendek III (2016-2021) Kebijakan Umum Panggilan dan Pengutusan Gereja (KUPPG), maka GPIB melalui Yapendik telah mempunyai 70 sekolah TK/SD/SMP/SMK/PT, serta terlaksananya Pendidikan Agama Kristen di daerah terpencil di mana GPIB hadir.

Pelatihan Guru/Kepala Sekolah

Pembekalan Guru pada semua tingkat : PAUD, SD, SMP, SMU/SMK untuk meningkatkan kinerja dan kreativitas serta menumbuhkan nilai-nilai Kristiani.

GPIB Mengajar

Program GPIB mengajar adalah program untuk memberi inspirasi dan semangat belajar kepada siswa dengan menghadirkan para profesional dibidang masing-masing.

Kegiatan1-Yapendik-GPIB

Beasiswa Guru

untuk meningkatkan kopentensi para guru Yapendik maka akan dilakukan sertifikasi untuk guru yang berjumlah sekitar 160 guru yang belum tersertifikasi. Dan untuk meningkatlan kompetensi guru dalam rangka pemenuhan standarisasi minimal S1, dan mencarikan sponsor beasiswa guru untuk mencapai Target S1. (Prioritas guru tetap Yapendik).

Yapendik Gemar Membaca

Yapendik Gemar Membaca adalah program untuk meningkatkan wawasan para guru dan murid Yapendik dengan memberikan kesempatan kepada murid dan guru setiap hari minimal 15 menit untuk membaca buku apa saja.